Exom

Um zu verstehen, was das Exom ist, ist es sinnvoll, zunächst zu erklären, was das Genom ist. Das menschliche Genom umfasst die gesamte DNA eines Menschen und besteht aus 3 Milliarden Nukleotiden oder „Buchstaben“ der DNA. 

Von der gesamten DNA enthält nur ein kleiner Prozentsatz (ca. 1,5%) die Informationen, die zur Herstellung von Proteinen, den funktionellen Akteuren des Organismus, benötigt werden. Dieser Teil des Genoms wird als Exom bezeichnet. Es besteht aus allen Exons des Genoms, d. h. den kodierenden Teilen der Gene. Der Begriff Exon leitet sich von „EXpressed regiON“ ab, da es sich hierbei um die Regionen handelt, die als Proteine exprimiert werden, im Gegensatz zum Intron oder „INTRagenic regiON“, das im endgültigen Protein nicht vertreten ist.

Wie in der vorhergehenden Frage beschrieben, umfasst das Genom die gesamte DNA eines Individuums, während das Exom nur die DNA-Fragmente umfasst, die Anweisungen für die Herstellung von Proteinen liefern. Das Exom macht 1% des Genoms aus, und die Funktion vieler menschlicher Gene ist bereits bekannt. Die verbleibenden 99% der DNA waren früher als „Junk-DNA“ bekannt, aber Entdeckungen der letzten Jahrzehnte haben gezeigt, dass viele der Bereiche, die als „Junk“ galten, eine sehr wichtige Rolle bei der Genregulation spielen. Es ist zu hoffen, dass in den kommenden Jahren weitere Einzelheiten über die Funktion dieser Regionen aufgedeckt werden.

Auf diese Frage gibt es keine eindeutige Antwort.

Es stimmt, dass das Genom den Nachweis von Varianten in nicht kodierenden Regionen und anderen Varianten ermöglicht, die durch das Exom nicht nachweisbar sind (z. B. strukturelle Varianten, Triplett-Wiederholungen, Inversionen, Deletionen …). Die Bedeutung eines Großteils dieser Informationen ist jedoch unbekannt.

Bisher sind die meisten bekannten krankheitsverursachenden Mutationen (ca. 85 %) in Exons zu finden, weshalb die Ganz-Exom-Sequenzierung eine wirksame Methode zur Ermittlung potenziell krankheitsverursachender Mutationen ist.

Die Erfahrung der letzten Jahre hat uns gelehrt, dass das Exom ein umfassender Ansatz ist, der in der Regel von Anfang an am erfolgreichsten ist, und zwar aus drei Gründen: Diagnosekapazität, Preis und Zeit.

Es gibt andere, einfachere und billigere Möglichkeiten, wie z. B. zunächst nur die häufigsten Mutationen (wenige Gene oder Panels) zu analysieren, in der Hoffnung, die Ursache zu finden.Das Problem bei diesen Optionen ist, dass bei einem fehlenden Nachweis einer Mutation immer die Frage bleibt, ob Sie eine Mutation haben, die mit diesen einfacheren Tests nicht nachgewiesen werden konnte. Das bedeutet, dass zur Klärung von Zweifeln weitere Tests durchgeführt werden müssen (um die nicht analysierten Mutationen zu analysieren). Das kostet mehr Geld und mehr Zeit, um eindeutige Ergebnisse zu erhalten. Kurzum, eine Exom-Analyse kann Zeit und Geld sparen.

Die diagnostische Kapazität hängt von der jeweiligen Krankheit oder Gruppe von Krankheiten ab, aber die Identifizierung pathogener oder sehr wahrscheinlich pathogener Varianten kann bis zu 40 % betragen, zum Beispiel bei Autismus-Spektrum-Störungen.

Darüber hinaus können in bis zu 40 % der Fälle (je nach Krankheit oder Krankheitsgruppe) Varianten unbestimmter Signifikanz (VUS, variants of uncertain significance) gefunden werden, die in regelmäßigen Abständen neu bewertet werden können, um festzustellen, ob sie mit der Pathologie in Verbindung stehen oder nicht.

Unter einem klinischen Exom versteht man im Allgemeinen eine Sequenzierung und Analyse nur der Exons der als krankheitsverursachend eingestuften Gene (ca. 4.800 Gene).

Das komplette Exom sequenziert alle Exons eines Individuums. Diese Informationen können dann für eine gezielte Analyse einer Krankheit (Charcot-Marie-Tooth, Marfan, Osteogenesis imperfecta usw.) oder einer Gruppe von Krankheiten verwendet werden, wenn die Symptome eher unspezifisch sind.

Der Preis für das Exom bei Genosalut beträgt 1.300 € und beinhaltet eine genetische Beratung vor und nach dem Test.

In der Regel übernimmt die private Krankenversicherung keine Kosten für die Exomanalyse. Es gibt jedoch bestimmte klinische Situationen, in denen sie die Kosten doch übernehmen.