Exoma

Para entender qué es el exoma, conviene empezar explicando qué es el genoma. El genoma humano comprende todo el ADN de un individuo y consta de 3.000 millones de nucleótidos o «letras» de ADN. 

De todo el ADN sólo un pequeño porcentaje (aprox. el 1,5%) contiene la información necesaria para producir las proteínas, los actores funcionales del organismo. A esta fracción del genoma se la conoce como exoma. Está formado por todos los exones del genoma, que son las partes codificantes de los genes. El término exón deriva de «EXpressed regiON«, ya que son las regiones que se traducen, o se expresan como proteínas, a diferencia del intrón, o «INTRagenic regiON«, que no está representada en la proteína final.

Como hemos descrito en la pregunta anterior, el genoma comprende todo el ADN de un individuo mientras que el exoma sólo comprende los fragmentos del ADN que proporcionan instrucciones para fabricar proteínas. El exoma representa el 1% del genoma y se conoce ya la función de muchos de los genes humanos. El 99% del ADN restante se conocía antiguamente como «ADN basura», pero los descubrimientos de las últimas décadas han demostrado que muchas de las zonas que se consideraban «basura» juegan un papel muy importante en la regulación de los genes. Cabe esperar que en los próximos años se averigüen más detalles sobre la función de estas regiones.

Esta pregunta no tiene una respuesta de blanco o negro.

Bien es cierto que el genoma permite la detección de variantes en regiones no codificantes y de otras variantes no detectables mediante el exoma (tales como variantes estructurales, repeticiones de tripletes, inversiones, deleciones…). No obstante, se desconoce la importancia de gran parte de esta información.

Hasta la fecha, la mayoría de las mutaciones conocidas que causan enfermedades(aprox. un 85%) se producen en los exones y por lo tanto la secuenciación del exoma completo es un método eficaz para identificar posibles mutaciones causantes de enfermedades.

La experiencia de los últimos años nos ha enseñado que el exoma es un enfoque global que suele ser el más acertado desde el principio y por tres motivos: capacidad diagnóstica, precio y tiempo.

Hay otras opciones más sencillas y baratas, como analizar primero sólo las mutaciones más comunes (pocos genes o paneles), con la esperanza de encontrar la causa. El problema de estas opciones es que si no se detecta una mutación, siempre queda la duda de si se tiene una mutación que no se podría detectar con estas pruebas más sencillas. Esto significa que para aclarar las dudas hay que hacer más pruebas (para analizar las mutaciones que no se analizaron). Esto cuesta más dinero y más tiempo para obtener resultados definitivos. En resumen, un análisis del exoma puede ahorrar tiempo y dinero.

La capacidad diagnóstica dependerá de la enfermedad o del grupo de enfermedades en cuestión, pero la identificación de variantes patogénicas o muy posiblemente patogénicas puede llegar a alcanzar el 40%, por ejemplo en casos de trastornos del espectro autista.

Además, en hasta un 40% de los casos (dependiendo de la enfermedad o del grupo de enfermedades en cuestión) se pueden obtener variantes de significancia incierta (VUS, variants of uncertain significance), que pueden reevaluarse con cierta periodicidad para determinar si están o no asociadas con la patología.

Generalmente se entiende por exoma clínico aquel que secuencia y analiza sólo los exones de los genes clasificados como responsables de enfermedades (4.800 genes aprox.)

El exoma completo secuencia todos los exones de un individuo. Con dicha información se puede luego hacer un análisis dirigido a una enfermedad (Charcot-Marie-Tooth, Marfan, osteogénesis imperfecta…) o a un grupo de enfermedades cuando la sintomatología es más inespecífica.

El precio del exoma en Genosalut es de 1.300€ e incluye las sesiones de asesoramiento genético previas y posteriores a la realización de la prueba.

Por norma general, los seguros privados no cubren el análisis del exoma. No obstante, existen determinadas situaciones clínicas en las que sí que cubren los gastos.